Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r72Q8K3N7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vmn1r72Q8K3N7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Vmn1r72Q8K3N7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Vmn1r72Q8K3N7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Vmn1r72Q8K3N7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r72Q8K3N7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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