Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sde2Q8K1J5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms