Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms