Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nhlrc3Q8CCH2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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