Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spef2Q8C9J3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms