Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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