Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc187Q8C5V8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc187Q8C5V8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc187Q8C5V8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc187Q8C5V8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc187Q8C5V8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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