Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms