Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms