Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms