Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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