Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sbno2Q7TNB8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms