Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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