Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms