Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atg9aQ68FE2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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