Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Capn3Q64691 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn3Q64691 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms