Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top2bQ64511 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms