Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnrpaQ62189 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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