Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3cQ62181 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms