Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms