Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms