Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2al1nQ497L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms