Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trmt1Q3TX08 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms