Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ttc21bQ0HA38 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ttc21bQ0HA38 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc21bQ0HA38 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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