Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
NrepQ07475 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms