Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms