Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb2Q00977 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms