Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Stx2Q00262 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms