Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim43cP86449 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43cP86449 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim43cP86449 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43cP86449 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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