Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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