Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
SbdsP70122 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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