Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Defb1P56386 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms