Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcd3P55096 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms