Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myo1bP46735 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms