Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdkn1bP46414 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms