Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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