Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RxrbP28704 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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