Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb2P27090 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tgfb2P27090 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgfb2P27090 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgfb2P27090 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgfb2P27090 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgfb2P27090 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb2P27090 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tgfb2P27090 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms