Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm2P23804 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm2P23804 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms