Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms