Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PdgfaP20033 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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