Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18528 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18528 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18528 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms