Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcnaP17918 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms