Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMC1P11047 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms