Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SlkO54988 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SlkO54988 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SlkO54988 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlkO54988 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlkO54988 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SlkO54988 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms