Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms