Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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