Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms