Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms