Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20878L7N244 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20878L7N244 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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